A Comissão Revisora de Contas é o órgão da Fundação responsável pelo controlo das contas. É constituída pelo Director-Geral do Orçamento, pelo Director-Geral da Acção Social e por três vogais designados respectivamente pela Academia das Ciências de Lisboa, pela Academia Nacional de Belas Artes e pelo Banco de Portugal, em representação dos Bancos e Casa Bancárias. As funções destes últimos vogais terão a duração de cinco anos, mas serão sempre renováveis.
A Comissão Revisora de Contas e uma acreditada firma de «chartered accountants» - actualmente a KPMG - são as entidades responsáveis pela fiscalização permanente das contas da Fundação.
Constituição da Comissão Revisora de Contas: